精彩回顾 | 自动化工作站的进阶之路
导语
近日,在中国国际智能产业博览会(Smart China Expo,简称“智博会”)上,华大智造自动化样本制备系统MGISP-100受到了广泛专注。为此,我们专门整理了MGISP-100的“产品小传”一篇,与您分享这款国产自动化产品的进阶之路。
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样本预处理是NGS工作流的第一步,包括核酸提取、样本制备(即建库)等环节。其中,在样本制备环节的“中间产物”——文库,影响着上机测序的成败。因此,这在NGS操作中,是非常重要的环节之一。
随着基因测序技术的发展,测序成本的降低,样本制备的成本和质量在一定程度上反而成为大部分NGS应用的瓶颈。传统样本制备繁复的操作流程、持续较久的建库值守给广大科研工作人员及测序实验人员带来了极大的不便。如何降低样本制备的成本,降低出错几率,提高测序前样本预处理的工作效率呢?
2015年,华大智造BGISEQ-500基因测序仪横空出世,引发业内关注。随即,与之配套的自动化样本制备系统的研发也在紧锣密鼓的进行之中。2016年,与基因测序仪堪称“完美CP”的自动化样本制备工作站MGISP-100雏形初现,并于2017年正式发布。
作为一款国产自动化产品,MGISP-100可替代人工完成核酸提取、PCR反应、文库构建等一系列实验操作,适用于多个NGS应用。以一个人的全基因组测序为例,经验丰富的实验人员手动建库至少需要9个小时的周转时间,而在使用MGISP-100之后,可以缩减至“手动1小时,自动6小时”。
MGISP-100采用集成化设计,集成了8通道移液器、PCR仪、温控设备、磁力架等功能模块,一次性可以完成16个样本的制备,复杂建库步骤一站式解决。
与此同时,MGISP-100配备多种已验证的配套试剂和分析软件,提供人性化的操作界面,不仅能够自动提示、指导手动操作,而且可以实时显示建库工作状态、追踪实验进度,并兼容测序系统的实验室管理信息系统,对于测序全流程的数据管理、信息管理而言,非常便利。因此,MGISP-100的很多早期用户也常常戏称“一机在手,建库不难”,即使是“小白”,经过简单的培训,也可以在MGISP-100的帮助下获得实验成功。
目前,MGISP-100已经积累了足够的可靠性测试数据,核心部件如移液器吸排液和扎TIP头动作已经完成99万次以上测试,可满足预期7年以上使用寿命。在NGS应用领域的实际数据表现也获得了初步的认可,能够缓解中小型实验室、医院、偏远地区的专业人员和资源不足等难题。2018年,MGISP-100不仅实现了规模化量产,而且陆续拿到了CE、CB、cTUVus等安全认证,获得了全球认可。
NGS应用全面拓展
目前,MGISP-100平台上已经实现十余种华大智造的建库流程,包括DNA文库制备,染色体拷贝数变异检测,RNA文库制备等等;也可以实现模块化流程如PCR体系构建,浓度稀释和均一化,磁珠纯化,单链环化等。当然,MGISP-100能做的还远不止于此,即使是非华大测序平台的建库流程、用户自定义开发流程等应用,也将陆续上线、持续更新。
自动化程度进一步延展
从自动化样本制备系统,到高通量自动化样本制备系统,再到模块化NGS工作站,MGISP-100“不是一个人在奋斗”。随着华大智造自动化家族产品线的日益丰富,MGISP-100也将迎来越来越完美的自己,不仅能够满足多样化的NGS应用,而且接受定制化的科研需求,甚至有可能打破现有的样本容量等基础设定,按需定制出厂。那将会是什么样子呢?新品发布在即,敬请期待!
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